Babak gugur Kejuaraan Perbara 2024 akan dimainkan dari 26 Desember 2024 hingga 5 Januari 2025.[1] Terdapat empat tim akan tampil pada babak ini untuk menentukan pemenang Kejuaraan Perbara 2024.
Setiap pertandingan pada babak gugur akan dimainkan dengan dua pertandingan kandang-tandang. Tim yang mencetak skor agregat lebih besar pada dua pertandingan tersebut menenangkan laga. Jika skor agregat imbang, maka peraturan gol tandang diterapkan, yaitu tim yang mencetak gol tandang lebih banyak menjadi pemenang laga. Jika gol tandang imbang, perpanjangan waktu dimainkan (tanpa menerapkan peraturan gol tandang). Jika skor tetap imbang hingga akhir perpanjangan waktu, maka pemenang laga ditentukan melalui adu penalti.
