Interim Register of Marine and Nonmarine Genera
Interim Register of Marine and Nonmarine Genera (IRMNG) adalah pangkalan data taksonomi yang mencoba untuk mencakup nama genus yang diterbitkan untuk semua domain kehidupan sejak tahun 1758 dalam zoologi (1753 dalam botani) hingga saat ini, yang disusun dalam satu hierarki taksonomi yang konsisten secara internal, untuk kepentingan inisiatif Informatika keanekaragaman hayati serta pengguna umum informasi keanekaragaman hayati (taksonomi). Selain berisi lebih dari 490.000 contoh nama genus yang dipublikasikan pada Maret 2020 (juga termasuk nama subgenus dalam zoologi), pangkalan data ini menyimpan lebih dari 1,7 juta nama spesies (1,3 juta terdaftar sebagai "diterima"), meskipun komponen data ini tidak dipertahankan dalam keadaan saat ini atau tidak lengkap seperti kepemilikan tingkat genus. Pengguna dapat mengakses data IRMNG secara daring dan juga tersedia sebagai snapshot berkala atau dump data untuk diimpor/diunggah ke sistem lain sesuai keinginan.
| Singkatan | IRMNG (Interim Register of Marine and Nonmarine Genera) |
|---|---|
| Tanggal pendirian | 2006 |
| Kantor pusat | Ostend, Belgia |
Manager & curator | Tony Rees |
Badan utama | Website |
Organisasi induk | Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation (2006-2014); Flanders Marine Institute (2016-current) |
| Situs web | www |
Keterangan
suntingIRMNG berisi nama ilmiah (hanya) dari genus, subset spesies, dan peringkat utama yang lebih tinggi dari sebagian besar tumbuhan, hewan, dan kingdom lain, baik yang hidup maupun yang punah, dalam hierarki taksonomi standar, dengan informasi terkait yang dapat dibaca mesin tentang habitat (mis. laut/non-laut) dan yang masih ada/fosil untuk sebagian besar entri.[1] Basis data ditujukan untuk menyediakan cakupan lengkap dari nama genus yang diterima dan tidak diterima di semua kingdom, dengan subset hanya nama spesies yang dimasukkan sebagai aktivitas sekunder. Dalam rilis Maret 2020, IRMNG memuat 492.620 nama genus, di mana 232.093 di antaranya terdaftar sebagai "diterima", 121.389 "tidak diterima", 7.462 status "lainnya" yaitu interim unpublished, nomen dubium, nomen nudum, taxon inquiryndum atau nama sementara, dan 131.676 sebagai "tidak pasti" (belum dinilai untuk status taksonomi saat ini).[2] Data berasal dari berbagai sumber cetak, online, dan basis data (biasanya spesifik domain), termasuk (antara lain) Nomenclator Zoologicus untuk hewan dan Index Nominum Genericorum untuk tumbuhan, dan disusun ulang menjadi struktur data umum untuk mendukung berbagai online kueri, pembuatan halaman takson individu, dan pasokan data massal ke proyek informatika keanekaragaman hayati lainnya. Konten IRMNG dija diperlukan ditampilkan secara bebas melalui web, dan mengunduh file data hingga peringkat taksonomi genus pada tanggal tertentu tersedia dalam format Arsip Inti Darwin (DwC-A). Data tersebut mencakup homonim (dengan otoritasnya), termasuk nama yang tersedia (diterbitkan secara sah) dan tidak tersedia yang dipilih.[3]
Perkiraan untuk "nama yang diterima" yang diadakan pada Maret 2020 adalah sebagai berikut, dirinci berdasarkan kingdom:
- Animalia : 239.093 nama genus yang diterima (± 55.350)
- Plantae : 28.724 nama genus yang diterima (± 7.721)
- Jamur : 10.468 nama genus yang diterima (± 182)
- Chromista : 11.114 nama genus yang diterima (± 1.268)
- Protozoa : 3.109 nama genus yang diterima (± 1.206)
- Bakteri : 3.433 nama genus yang diterima (± 115)
- Archaea : 140 nama genus yang diterima (± 0)
- Virus : 851 nama genus yang diterima (± 0)
Rentang ketidakpastian yang dikutip muncul karena IRMNG mencantumkan nama "tidak pasti" (tidak diteliti di dalamnya) selain nama "diterima" yang diketahui; nilai yang dikutip adalah rata-rata dari nama "diterima" saja (semua nama "tidak pasti" diperlakukan sebagai tidak diterima) dan nama "diterima + tidak pasti" (semua nama "tidak pasti" diperlakukan sebagai diterima), dengan rentang ketidakpastian terkait yang menunjukkan dua ekstrem ini .
Lokasi basis data
suntingIRMNG diprakarsai dan dirancang oleh ahli biologi dan manajer data Australia Tony Rees pada tahun 2006.[1][4] Untuk karyanya dalam proyek ini dan proyek lainnya, GBIF memberinya Penghargaan Ebbe Nielsen 2014.[4] Dari tahun 2006 hingga 2014 IRMNG berlokasi di CSIRO Marine and Atmospheric Research (Badan Penelitian Kelautan dan atmosfer CSIRO), dan dipindahkan ke Flanders Marine Institute (Institut Kelautan Flanders) (VLIZ) selama periode 2014–2016; dari 2016 dan seterusnya semua rilis telah tersedia melalui situs web barunya www.irmng.org yang diselenggarakan oleh VLIZ.[1][5] VLIZ juga menjadi tuan rumah Daftar Spesies Laut Dunia (World Register of Marine Species/WoRMS), menggunakan infrastruktur umum.[6]
Penggunaan
suntingKonten dari IRMNG digunakan oleh beberapa proyek Informatika Keanekaragaman Hayati global termasuk Open Tree of Life,[7] Global Biodiversity Information Facility (GBIF),[8] dan Encyclopedia of Life (EOL),[9] selain yang lain termasuk Atlas of Living Australia[10] dan Global Names Architecture (GNA)'s Global Names Resolver.[11] Mulai tahun 2018 dan seterusnya, data IRMNG juga digunakan untuk mengisi hierarki taksonomi dan memberikan nama generik untuk berbagai taksa di bidang protista (kerajaan Protozoa dan Chromista) dan alga tumbuhan (Charophyta, Chlorophyta, Glaucophyta dan Rhodophyta) di Katalog kehidupan.[12]
Referensi
sunting- ^ a b c "IRMNG - Interim Register of Marine and Nonmarine Genera". IRMNG. Diakses tanggal 23 May 2019.
- ^ "IRMNG - Download". IRMNG. Diakses tanggal 2 April 2019.
- ^ "IRMNG: Homonyms". IRMNG. Diakses tanggal 2018-12-10.
- ^ a b "IRMNG - Interim Register of Marine and Nonmarine Genera". IRMNG. Diakses tanggal 23 May 2019.
- ^ "The Interim Register for Marine and Nonmarine Genera (IRMNG) will move from CSIRO to VLIZ". marinespecies.org (dalam bahasa Inggris). Diakses tanggal 10 December 2018.
- ^ "Interim Register of Marine and Nonmarine Genera (IRMNG)". Lifewatch regional portal. LifeWatch. Diakses tanggal 10 December 2018.
- ^ Open Tree of Life developers. "Taxonomy release ott3.0 -" (dalam bahasa Inggris). Open Tree of Life. Diakses tanggal 10 December 2018.
- ^ "The Interim Register of Marine and Nonmarine Genera". GBIF. 2018. doi:10.15468/6tkudz. Diakses tanggal 10 December 2018.
- ^ "IRMNG". Encyclopedia of Life. Diarsipkan dari versi asli tanggal 1 April 2018.
- ^ "AtlasOfLivingAustralia/ala-name-matching". Atlas of Living Australia. Diakses tanggal 18 December 2018.
- ^ "Global Names Resolver: Names Data Sources". Diakses tanggal 18 December 2018.
- ^ "IRMNG". Catalogue of Life. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2020-10-26. Diakses tanggal 25 July 2020.
Bacaan lebih lanjut
sunting- Rees, Tony (2008). "18.8. IRMNG—the Interim Register of Marine and Nonmarine Genera" (PDF). The Proceedings of TDWG. 2008: 72–73.
- Rees, Tony; Vandepitte, Leen; Decock, Wim; Vanhoorne, Bart (2017). "IRMNG 2006–2016: 10 years of a global Taxonomic Database". Biodiversity Informatics. 12: 1–44. doi:10.17161/bi.v12i0.6522.
- Rees, Tony; Vandepitte, Leen; Vanhoorne, Bart; Decock, Wim (2020). "All genera of the world: an overview and estimates based on the March 2020 release of the Interim Register of Marine and Nonmarine Genera (IRMNG)". Megataxa. 1 (2): 123–140. doi:10.11646/megataxa.1.2.3.